急性的咽后脓肿常伴有怕冷、发烧、咽喉痛、食欲不振、讲话吐字不清、似口中有物体、哭声刺耳、脓肿变大、还可能会出现睡眠打呼及吸气性呼吸障碍等。

慢性脓肿病程比较长，常伴有低烧、浑身盗汗等症状。咽后壁脓肿的特征，像急性脓肿患者颈部会僵直头偏向患病的一侧，这样可以减轻疼痛及呼吸困难，咽后壁一方的充血隆起。

慢性脓肿会伴有后咽后粘膜苍白，全咽后隆起等症状。两种类型的脓肿都可能出现颌下淋巴结及颈淋巴结肿痛等症状。咽后脓肿可以通过手术的方式来治疗，手术后脓肿就会消除。