扁桃体疼痛，可能是下列原因造成：

首先，扁桃体本部位的疾病，有可能会导致疼痛症状出现。如果患上急慢性的扁桃体炎，或是患有扁桃体周围脓肿、扁桃体结石等疾病，都有可能造成局部因为炎症感染，或者是结石形成等刺激，导致疼痛感出现。

其次，扁桃体周边的疾病影响。如果患上急慢性的咽喉炎、会厌炎、咽峡炎等疾病，由于上述疾病产生的刺激性分泌物，都会蔓延至扁桃体部位，就会形成扁桃体的刺激性疼痛感。