新生儿衣原体感染是由于母亲感染了衣原体，导致有一些子宫内膜，慢性炎症和阴道炎，在新生儿出生的过程中，便感染的新生儿，使新生儿出现的衣原体感染的症状。

病原体为沙眼衣原体，衣原体主要存在于母亲慢性子宫内膜炎或者是子宫阴道的一些炎症，胎儿经过产道分娩时候就会出现感染。

往往有一些衣原体的感染，还会出现上行感染的情况，新生儿感染衣原体以后，就可能出现结膜炎、肺炎，这些情况出现的这个情况主要表现，眼睛出现的分泌物，发生肺炎的情况一般在，新生儿更晚一点才会出现，一般情况1～3个月发生，衣原体感染的时候要尽量的治疗。