糖原贮积病目前没有有效的方法可以根治，只能通过一些治疗手段来缓解症状。因为它属于一种染色体异常所引起的遗传性疾病，总体治疗原则是对于低血糖、高尿酸血症等疾病进行最大程度的预防。

对于具体治疗方案应该根据不同的病症进行选择，因为每个患者的病情严重程度都是有所不同的。通常较小的婴儿病情都会比较重，年龄稍大些的病情要相对轻一点，平时多进行些有氧运动可以非常有效地对病情进行控制。

大部分二型的糖原贮积病通过物理治疗会有较好的反应，常用的治疗方法是酶代替治疗、手术切除肿瘤，以及肝脏或者心脏的移植。