肩胛骨内侧疼痛应根据引发的原因进行对症治疗。

如果是因为在睡觉时肩胛骨内侧肌肉着凉或长时间过度劳累，导致肩胛骨内侧劳损所引起，通常是因为局部血运不畅、气滞血瘀导致的疼痛，这时患者应注意适当休息，减少肩胛骨部位的活动量，主要局部保暖，避免着凉。可针对疼痛部位进行热敷、按摩、微波仪治疗、理疗仪烤电等，可促进局部的血液循环，减轻疼痛症状。如果疼痛难以忍受，可针对痛点进行封闭治疗。

如果为局部组织炎症或损伤所引起，可外敷活血止痛的膏药，比如伤湿止痛膏、通络化瘀膏。同时配合服用通络止痛的药物，比如通络开痹片、活血止痛胶囊等。