长时间咳嗽大部分是由于呼吸系统疾病引起，比如慢性阻塞性肺疾病、肺部占位性病变、支气管扩张症、慢性支气管炎等。

另外，一部分之前患上呼吸道感染的患者，经过治疗后其他症状有所改善，但是咳嗽有可能会持续一段时间，此为感染后咳嗽。如果除了长时间咳嗽外，伴随体重减轻、食欲不振、身体乏力等现象，也可能与肺结核有关。

除此之外，上气道咳嗽综合征、慢性嗜酸粒细胞性支气管炎以及胃食管反流病等，都有可能引起长时间咳嗽，需要完善相关检查才能明确诊断。