引起胎儿畸形的原因非常多，部分胎儿畸形是因为本身染色体发育有问题，也有可能是遗传，还有可能就是受精卵在发育的过程中受到不良刺激，包括射线、化学药品或者是激素等，导致其基因发生突变引起来的胎儿发育畸形。

当然，有些胎儿畸形是由妊娠并发症引起的，比如孕妇并发甲状腺功能减退，或者甲状腺功能亢进，就有可能会导致胎儿发育畸形，甚至胎儿会有智力的问题，如甲状腺功能减退，导致新生儿呆小症等。

另外如果妊娠期并发糖尿病，或者高血压及严重贫血和高热疾病等，都有可能会导致胎儿发育畸形。