肛瘘的主要原因就是肛门周围脓肿在形成以后，进行了人为切开放脓或者是发生了自行的溃破，最后遗留下了管道，一般会有外口的存在，外口通过管道和肛内相通。

导致肛瘘比较常见的原因，还是生活作息时间的不规律。比如经常有一些辛辣刺激性饮食的情况，或者是饮食上过于油腻，经常地发生便秘或者是腹泻的情况，都可以使肛窦发生感染，最后导致肛门周围脓肿的形成，进一步破溃就形成了肛瘘的情况。

另外，由于作息时间的不规律，肛门局部压力的持续增加以及外伤等，也都是肛瘘发生的常见原因，肛瘘的治疗主要也是以手术治疗为主。