男性生殖器畸形，一般是指阴茎畸形，阴茎畸形包括包茎、包皮过长、隐匿性阴茎、蹼状阴茎、阴茎短小等，包茎、包皮过长是最常见的疾病，包茎是指包皮完全包绕阴茎头，不能外翻露出龟头，包皮过长是包皮包绕阴茎头，可以外翻露出龟头。

隐匿性阴茎外观短小，包皮口与阴茎根部距离短，包皮鸟嘴状包住阴茎，包皮背侧短、腹侧长、内板多、外板少，阴茎短小是指阴茎长度小于正常阴茎长度，平均值2.5厘米。