慢性附睾炎与睾丸扭转在病因、症状、体征、治疗上完全不同。慢性附睾炎和睾丸扭转属于两个不同的疾病。

从病因上看，慢性附睾炎是由于致病菌侵犯附睾导致的炎症，而睾丸炎是由于各种因素导致的睾丸扭转。从症状和体征上看，慢性睾丸炎可以引起附睾疼痛，其疼痛程度较轻，为隐痛，而睾丸扭转可以引起睾丸剧烈的疼痛。

在治疗上两者完全不同，前者主要是行抗感染治疗，而后者主要行手术治疗。手术治疗的意义在于恢复睾丸的血液供应，避免睾丸发生萎缩、坏死等相关的并发症，导致睾丸的功能下降。