先天性胆总管囊肿这种疾病发病率并不高，但如果有这种病建议早期手术干预，以预防癌变。

手术方式可以选择腔镜手术和传统的开腹手术，根据不同的手术方式，以及不同的医院级别、不同的城市，手术费用存在明显的区别。

单纯的传统手术在一般的地级市医院费用在2万元左右，而在省级医院费用可能在3万元左右。如果在此基础上选择腔镜手术，在一般的地级市医院费用可能4万，而在省医院费用大概在5万左右。