巧克力囊肿比较大，怀孕后一般不是太安全。

首先，巧克力囊肿如果很大，比较容易影响卵巢内分泌功能，引起卵巢内分泌功能下降，导致内分泌失调等。如果怀孕后卵巢分泌的孕激素和雌激素不足，就会影响胎儿健康发育，比较容易引起流产等现象。

其次，如果巧克力囊肿很大，怀孕后，孕妇在运动过程中，非常容易引起巧克力囊肿发生破裂，导致卵巢大出血。发生这种情况后，需要及时手术处理，对胎儿也会产生不利影响。