3个月的宝宝消化不良，可以通过腹部顺时针按摩、更换奶粉、服用益生菌进行调理。

1.腹部顺时针按摩。3个月宝宝消化不良可能是由于消化系统还没有发育完善，导致胃动力不足，可以通过腹部按摩的方法进行改善。按揉有渗透力，能够促进肠蠕动和促进消化的作用。

2.更换奶粉。3个月宝宝如果选择的奶粉里面脂肪含量比较高，通常会引起消化不良的情况，可以及时更换奶粉进行改善。

3.服用益生菌。益生菌能够起到调理肠道菌群的作用，有助于促进食物的分解和吸收，增强胃动力，对于宝宝消化不良能够达到很好的效果。