西医学认为肛周脓肿和肛瘘分别属于肛周间隙化脓性感染的两个不同的阶段，急性期是肛周脓肿，慢性期是肛瘘。由此可见，肛瘘是肛周脓肿发展到后期的一种结局，它的病因、病理与肛周脓肿是一致的。

换句话说，肛瘘其实就是肛周脓肿的后遗症。肛周脓肿肿痛很久后会自然破溃，脓液流出后，脓腔壁的结缔组织和肉芽组织会增生，脓腔缩窄成管状，外口缩小而内口继续存在，而且会反复不断的感染，不能自愈就变成了肛瘘。

所以，在肛周脓肿成脓期就应该及时进行手术治疗，以防止进展形成肛瘘。