小耳畸形是可以检查出来的。

首先，专业的医生如果想要通过医学实验的方式来诊断，是否有小耳畸形的情况，通常会对患儿进行听性脑干反应测试。通过此项测试，可判断患者的听力以及脑部反应是否有异常。

同时，结合患儿耳廓部位的外观，例如耳廓的大小或者形态有明显的异常，甚至存在耳廓部分的缺失，可以诊断为小耳畸形。此类先天性疾病的治疗，需要根据患儿发育畸形的严重程度以及对生活的影响，来确定是否需要进行手术治疗。