白喉与手足口病的区别主要在于临床症状、感染病原微生物，以及治疗。

白喉的感染病原微生物为白喉棒状杆菌，手足口病的感染病原微生物为病毒，同时其致病病毒种类较多，在临床上已确诊的约为20多种。

在临床症状上，白喉以发热、咽痛、犬吠样咳嗽为主，查体可发现咽部伪膜附着。手足口病的典型症状为发热、咳嗽、咳痰，以及口咽部典型疱疹症状。

白喉的治疗以白喉抗毒素以及抗菌素为主，手足口病缺乏特异性治疗，以一般对症治疗为主。