有巧克力囊肿的时候，首先可以通过临床的症状来初步的判断。曾经有过人流史或者是剖宫产时，也有可能是有做过输卵管通液，这一类的手术会容易引发，进行性的痛经的表现。

出现有进行性痛经的时候，那需要做个妇科的检查。做妇科检查的时候，可以摸到重大的卵巢，在这期间会有轻微的触痛。这就需要及时的做b超，或者是腹腔镜的检查。做腹腔镜检查是最有权威的诊断。

做腹腔镜检查的时候，能够面对盆腔进行性的监测，能够准确的找到子宫内膜异位症的位置以及病因，并且对其进行精确的诊断。