脑炎的患者出现头痛时，首先要应用一些对症的药物，比如口服布洛芬和吲哚美辛，同时也要分析病因，进行病因治疗。大多数考虑是高颅压引起，可以应用甘露醇、甘油果糖和呋塞米来降低颅内压。

也有可能是病毒感染引起的患者发热而导致。如果体温超过38.5℃时，应进行退热治疗，临床上常用的药物有赖氨匹林、柴胡注射液、氨基比林注射液和对乙酰氨基酚等。

患者如果头痛症状严重的情况下，也可以应用一些其他的止痛药，比如肌肉注射平痛新等，但是临床上一般不作为首选药物治疗。