来月经时肛门一阵一阵疼痛，有可能是盆腔炎、子宫内膜异位症，也有可能是痔疮发作引起的。

来月经时女性的抵抗力较差，盆腔处于充血状态，子宫出现收缩引起肛门一阵一阵疼痛。特别是本身患有盆腔炎、子宫内膜异位症的人，在月经期肛门疼痛会比较明显。也有可能是来月经时刚好痔疮发作，痔疮脱出肛门充血、水肿，或者形成了血栓性外痔，也可引起肛门出现一阵一阵的疼痛。

建议月经过后，去医院肛肠科查明引起肛门阵痛的病因，对症治疗原发疾病，才可以改善肛门疼痛。