目前下咽恶性肿瘤的病因机制，还没有完全弄清楚，临床认为其可能与多种因素有关，最常见的因素是吸烟，烟草中的致癌物质可能导致染色体发生畸变，与大多数呼吸道肿瘤都有密切的联系。

长期饮酒也是危险因素之一，酒精会刺激咽部黏膜，引起细胞增生，甚至导致癌变。EB病毒与鼻咽癌密切相关，也是下咽恶性肿瘤的高危因素之一。除此之外，机体自身营养不良也会导致免疫力低下，更加容易受到肿瘤的侵袭。

下咽恶性肿瘤最常见的病理类型是鳞癌，目前首选的治疗方式是外科手术治疗，而下咽位置隐蔽，早期较难发现，故预后较差。