小儿出生有附耳是先天性耳廓畸形的表现，考虑是以下的原因：

1.如果遗传因素或者基因发生突变，会引起小儿出生时有附耳的表现。

2.在母亲体内如果怀孕的时候母体受到病毒感染，比如风疹病毒感染，容易造成胎儿的发育障碍，导致出生时有附耳。

3.母亲在怀孕的时候，如果受到外伤或者内分泌方面的疾病，也会引起胎儿在宫内生长发育时受到障碍，形成先天性的耳廓畸形。

4.怀孕时母体受到放射线或者化学物质的影响，也可导致胎儿的耳朵发育出现畸形。此外某些药物造成损害，比如服用甲氨蝶呤会引起毒副作用，导致胎儿的耳部发育畸形。