卵巢囊肿手术主要有两种，一种是专门针对于囊肿的切除手术，一种是卵巢的全切手术。具体选择哪一种方式进行治疗，需要取决于卵巢囊肿的性质以及大小，还有发展的速度以及病情的变化。因为卵巢对于女性来说有着特别重要的意义，它是正常女性月经周期的重要组成部分，所以能不做卵巢全切手术，就尽量不要做全切手术。如果患者在45周岁以内，尚未绝经最好选择卵巢囊肿的针对性切除术，如果患者已经超过了45岁，而且是已经绝经的女性，可以选择卵巢全切手术。