巧克力囊肿的治疗方法可以有期待疗法、药物治疗、手术治疗及联合治疗等。病人的临床表现主要有月经紊乱、痛经、不孕等。

如果病人没有明显的临床症状，可以采取期待疗法。如果有明显盆腔的疼痛、月经改变，囊肿较小患者有生育要求可以先给予药物治疗。

如果药物治疗效果不明显或者病情逐渐加重，生育功能未改善，一侧或双侧囊肿逐渐长大，有时增大的囊肿还会破裂感染，应选择手术治疗。建议到医院做相关检查，选择合适的治疗方法。