药物避孕能够预防巧克力囊肿的。巧克力囊肿可以在医生指导下口服避孕药，避孕药含有的雌激素和孕激素能够延缓巧克力囊肿的生长速度，有利于病情的控制，药物避孕对预防巧克力囊肿也有一定的效果。

想要预防巧克力囊肿的发生，注意合理的避孕措施，可以服用避孕药避孕。月经期间严禁同房，保持良好的情况。

如果已经患有巧克力囊肿可以通过手术的方法治疗，术后也可以使用中药或是促性腺激素释放激素类药物3个月左右，预防巧克力囊肿的复发。巧克力囊肿若是破裂可引起腹痛症状。