生殖器上长水疱，首先要观察是由病毒还是由细菌所引起。

单纯疱疹引起的水疱，可以外涂阿昔洛韦乳膏。如果只是单纯细菌感染所引起可以外涂莫匹罗星软膏。自己很难完全区别，可以让有经验的皮肤科医师给予诊断。小水疱过多或慢慢变大时，建议及时地进行穿刺、引流将液体放出并有利于水疱的恢复。

平时也要注意清洁，每天清洗这样可以防止病毒或细菌出现滋生，可以防止水疱的加重和反复发生。饮食方面要注意，尽量在起水疱之后，避免吃辛辣油腻食物，多喝些水，多吃些蔬菜和水果。