吞咽时鼻腔疼痛多半是由于鼻咽炎，或者是舌咽神经痛等疾病导致，也就是患者的鼻腔存在发炎以及水肿，并且在饮食不当时就会刺激到鼻腔根部，从而产生疼痛。

建议可以做鼻镜以及喉镜的检查，并同时配合着消炎、消肿类的药物进行治疗。在患者患有咽喉部或者鼻部疾病时，通常在吞咽时会牵扯到鼻腔部位，从而产生疼痛感。

也不排除患者本身有过敏性鼻炎或干燥性鼻炎，鼻炎患者在发病时也会有这种症状。在鼻炎患者接触到刺激气味或者是空气干燥，也会导致吞咽时鼻腔疼痛。