食管平滑肌瘤虽为良性肿瘤，但其有恶变倾向，所以建议肿瘤直径大于2厘米，压迫到周围脏器，没有不能耐受手术的患者，一旦明确诊断，都应手术治疗，吃药是不能消除食管平滑肌瘤的。

一般手术过程顺利，术后病检为良性的患者，术后即为治愈，复发非常罕见。如果肿瘤体积小，直径小于2厘米无任何症状的患者，可以追踪观察其变化。

因年老体弱、心肺功能低下等不能耐受手术的患者，单纯的药物保守治疗效果不佳，可采用放射治疗、低温治疗、激光治疗等综合治疗的方法，控制病情的复发和发展。