肛瘘可能会引起全身感染。

因为肛瘘本身就是一种感染性疾病，它是肛周脓肿的后遗症，如果外口及瘘管引流通畅，肛瘘就会处于稳定期或慢性感染期，患者没有明显不适的症状或只有轻微的肛周胀痛感，不会出现全身感染的情况。

如果外口及瘘管引流不畅，大量的坏死物质及脓液积存在瘘管内，就会导致新的肛周脓肿，脓肿的脓液未及时引流出来，脓液中的毒素吸收入血就会发生全身感染。