冠状动脉瘤有一部分可能跟遗传因素有关，冠状动脉瘤分为先天性冠状动脉瘤和后天性冠状动脉瘤。由于辐射、遗传因素，引起冠状动脉发育异常、动脉壁坏死变性，导致先天性冠状动脉的发生，因此先天性的可由遗传导致。

而后天性的冠状动脉瘤通常不会遗传，是由以下原因导致：冠状动脉粥样硬化，使血管内膜损伤、钙化，引起血管弹性减弱、血管壁耐受压力的能力减弱，从而导致血管扩张产生动脉瘤。

此外，川崎病、感染类疾病、结缔组织疾病，也可能导致冠状动脉瘤的发生。