手足口病鉴别诊断需进行血常规检查、粪便病毒核酸检测、咽拭子或疱疹液病毒分离、血清学抗体检测、脑脊液检查。具体分析如下：
1.血常规检查：手足口病初期白细胞计数多正常或轻度升高，重症病例可出现白细胞明显增高或降低，淋巴细胞比例上升有助于区分细菌感染。部分患儿伴随血小板减少或C反应蛋白升高，需结合临床表现排除其他发热性疾病。
2.粪便病毒核酸检测：通过聚合酶链反应检测肠道病毒特异性核酸，尤其是柯萨奇病毒A16和肠道病毒71型，阳性结果可明确病原体。该方法灵敏度高，适用于病程早期，但需注意与其他肠道病毒感染相鉴别。
3.咽拭子或疱疹液病毒分离：采集疱疹液或咽部分泌物进行病毒培养，分离出致病病毒可确诊。病毒分离耗时较长，但对病原学鉴定具有重要意义，尤其适用于重症病例或流行病学调查。
4.血清学抗体检测：检测血清中特异性IgM抗体，阳性提示近期感染。恢复期抗体滴度较急性期升高4倍以上有诊断价值，但抗体产生较晚，不适用于早期诊断，需结合其他检查综合判断。
5.脑脊液检查：重症患儿出现神经系统症状时需进行腰椎穿刺，脑脊液压力增高、白细胞轻度增多或蛋白升高提示可能并发脑炎或脑膜炎，需排除其他中枢神经系统感染性疾病。
诊断过程中需结合流行病学史与临床表现，避免过度依赖单一检查结果。重症病例应密切监测生命体征，及时评估心肺功能与神经系统状态。疑似病例需隔离观察，防止交叉感染。
