重症肌无力的鉴别主要依靠临床表现、药物试验和实验室检查综合判断。该病以骨骼肌无力和易疲劳为特征，症状晨轻暮重，活动后加重，休息后缓解。典型表现为眼睑下垂、复视、吞咽困难或肢体无力，需与Lambert-Eaton综合征、吉兰-巴雷综合征等疾病区分。
鉴别时需重点关注症状波动性和分布特点。新斯的明试验是重要诊断手段，注射后肌力明显改善支持诊断。重复神经电刺激显示低频刺激波幅递减，单纤维肌电图显示颤抖增宽具有特异性。血清乙酰胆碱受体抗体检测阳性率约85%，抗MuSK抗体检测可提高检出率。胸腺CT或MRI检查有助于发现胸腺瘤或胸腺增生。Lambert-Eaton综合征多伴发小细胞肺癌，高频神经电刺激波幅递增；吉兰-巴雷综合征呈急性对称性瘫痪，脑脊液蛋白-细胞分离；肉毒中毒有明确中毒史，瞳孔常扩大。
鉴别过程中需注意症状可能突然加重导致肌无力危象，需紧急处理。部分患者抗体检测阴性但临床表现典型，不能排除诊断。糖皮质激素治疗初期可能出现暂时性症状恶化。合并胸腺瘤需多学科评估手术指征。避免使用氨基糖苷类抗生素、奎宁等加重症状的药物。妊娠期患者症状可能波动，需调整治疗方案。老年患者需注意与脑血管病鉴别。随访中定期评估呼吸功能和吞咽功能，警惕危象发生。
