原发性脑干损伤可以是硬瘫，也可以是软瘫。

原发性脑干损伤在所有的原发性脑损伤当中是最严重的一种。患者在早期的时候可能是软瘫，也就是四肢的肌张力比较低下，因为这个时候，大脑和脑干的功能属于脑休克状态。因此，患者的肌张力低下，腱反射消失或者是减弱。

随着脊髓功能锥体束的恢复，患者四肢肌张力开始恢复，肌张力逐渐增高。因此在原发性脑干损伤，脊髓功能恢复以后，患者表现为硬瘫。这个时候患者表现为肌张力增高、腱反射活跃、腱反射亢进，同时出现病理反射。