治疗大肠癌埃希杆菌性胃肠炎的药物，主要的是抗菌药物，如第3代头孢类药物以及第4代类头等头孢类药物。

对于治疗大肠杆菌有很好的杀灭作用，以及喹诺酮类的药物，也有杀灭大肠癌细菌的药物作用，如左氧氟沙星、氟哌酸等。

如果出现脱水，也要及时的补充液体，如果出现酸中毒，要使用碱性液来纠正酸中毒，若有电解质紊乱，应该进行电解质的检查，确定是哪一种电解质紊乱，如低钠血症等，然后再进行有针对性的治疗。