侧睡时肩膀痛，最常见的原因为肩周炎。肩周炎时可以在睡觉时肩膀受压导致肩膀疼痛，可以出现肩关节各个方向活动受限，这时要检查肩关节X线片、核磁共振进行诊断。

另外，其他原因也可以导致侧睡时肩膀痛，比如肩关节受风着凉，可以出现侧位时肩膀疼痛，常为急性疼痛。这时要进行相关X线片检查，排除其他疾病，早期给予物理治疗。

一些其他原因，比如肩关节周围韧带损伤，或者肩袖损伤，也可以有侧睡时肩膀疼痛，多见于外伤或者老年人退变，这时要检查肩关节的核磁共振进行诊断和治疗。