自身免疫性胰腺炎可以手术治疗，但是在手术治疗之前，需要充分掌握手术的指针。该疾病可以先通过保守治疗的方式治疗，包括口服激素治疗，必要时还可能需要联合使用抗胰酶制剂。

具体药物的使用效果要根据个人情况决定。如果通过激素治疗效果欠佳，疼痛逐渐加重并且有合并假性囊肿时，可能需要进行手术治疗。进行手术治疗的方式不同，可能手术费用也有所不同。可以到医院就诊后，咨询手术的医生，可以明确具体的费用，大部分患者进行手术治疗都需要1万块钱左右。