碘缺乏的症状有很多，根据年龄段分类。2015年的中国加碘指南是根据年龄段来分的，在所有年龄组，不管成人还是儿童的，共有表现是甲状腺肿大。

甲状腺代偿性增生表现为轻中重度肿大。如果是重度肿大，可能会压迫食管、气管及神经系统，导致吞咽呼吸困难或声音嘶哑。甲状腺功能减退症常常表现为乏力、便秘、水肿。

所有年龄组对核辐射的敏感性明显增加，在胎儿期，碘缺乏会造成流产、死产、先天畸形及围产期死亡率明显增加。在新生儿期主要是表现为地方性克汀病，包括智力落后、聋哑、痉挛性瘫痪、斜视和身材矮小及死亡率明显增加。儿童和青少年主要表现为精神功能受损、体格发育迟缓。在成人表现为精神功能受损及碘性的甲状腺功能亢进症。

甲状腺功能亢进症，是长期缺碘后甲状腺素合成减少，促甲状腺激素水平明显增高，这时进行补碘时，很容易造成碘性甲状腺功能亢进症。