来月经第一天肚子疼的原因如下：

1.月经第一天肚子疼考虑为痛经，痛经分为原发性痛经以及继发性痛经。继发性痛经一般是子宫器质性病变造成的，比如子宫腺肌症、卵巢巧克力囊肿等。还可能是子宫畸形引起，比如阴道横隔或者宫颈粘连等，经血无法顺利排出导致腹痛。

2.如果除外器质性病变考虑是原发性痛经，原发性痛经的发生和前列腺素有关，前列腺素造成子宫平滑肌收缩以及血管痉挛造成痛经。

3.一部分女性害怕来月经，有紧张、焦虑等情绪或者对疼痛敏感，也会感觉到腹部疼痛明显。