早晨咳嗽厉害的原因，多与冷空气刺激呼吸道有关系。

早晨咳嗽，有可能是有慢性咽炎或支气管炎。晚上睡觉痰液储存在气道，早晨起来冷空气刺激呼吸道，反射性将痰液咳嗽排出体外，所以早晨起来咳嗽厉害。因此需要查明病原体，针对病原体应用药物治疗。

另外，还有就是早晨咳嗽厉害，可能与过敏因素有关系，与气道高反应状态有关系。这种情况，可能会引起过敏性咳嗽，或咳嗽变异性哮喘发作，需要使用抗过敏药物及降低气道高反应，缓解症状。