孩子高烧39℃，首先，可以及时服用小儿退热药物进行治疗，比如口服儿童类退热药物或者小儿退热栓纳肛等，能够有效控制体温继续上升。

其次，可以辅助物理降温的方法，比如额头局部贴退热贴。通过退热贴中凝胶水分的散发，也能够起到一定的退热效果。

再者，可以由专业的医生采取冷盐水灌肠的方法，促进体温进一步下降。

另外，如果孩子高烧39℃，通过上述退热措施，体温开始慢慢下降，这时也可以进行温水擦浴，能够加快降温过程。但是要注意补充水分，以免孩子大量出汗以及脱水的现象。与此同时，要进行相关实验室检查和临床体格检查，这样明确孩子高烧的病因，尽早针对病因进行治疗。