首先衣原体体细胞培养进行碘染色和荧光抗体染色。侧观察灯增值的包涵体衣原体体细胞学检查，对感染细胞、涂片进行吉姆萨或者点染色观察包内。包涵体直接免疫荧光直接免疫荧光检查细胞图片中的衣原体，此法敏感性及特异性高简单快速。核酸扩增试验核酸扩增试验，对医原体靶序列进行特异性的扩增，其中连接酶链反应敏感性及特异性高，可检测尿道和宫颈晨尿等标本，进行详细的进行检查确诊。