肛门息肉发炎，首先就是通过抗生素软膏肛管直肠内给药，通过肛管直肠的黏膜组织吸收入血，而发挥消炎的作用。

另外，可以使用一些消炎的中药成分的制剂进行保留灌肠，比较常用的有康复新液，有复方黄柏涂剂，也可以自拟中药处方进行保留灌肠。

肛门息肉发炎明显的，还可以适当地口服抗生素药物进行对症的治疗。如果肛门息肉反复地出现炎症性的反应，也可以考虑做切除的治疗，一般是在肠镜下通过烧灼等方法进行去除。

肛门息肉出现了发炎，也要积极地治疗原发的疾病，特别是一些溃疡性的结肠炎，引发的肛门息肉，需要使用五氨基水杨酸制剂进行对症的治疗。