早上咳嗽厉害的原因与痰液过多有关，也可能与吸入的冷空气以及空气中粉尘数量增加有关。

痰液是呼吸道发生感染时而形成的一种渗出物，在夜间由于痰液没有及时地排出，而淤积在呼吸道内，当早晨起床后体位发生改变，痰液就会出现流动，就会对呼吸道造成刺激而诱发咳嗽，这是引起早晨起床咳嗽症状加重的主要原因。

由于冷空气对呼吸道黏膜造成的刺激，同样会加剧咳嗽的症状，这也是早晨和夜间咳嗽症状加重的原因之一。由于所处的环境中粉尘数量增加，刺激呼吸道黏膜，也同样会引起咳嗽。