两边太阳穴胀痛有几种原因，原因不同用药也不同：

一、血管神经性头痛，可以口服西比灵、正天丸等药，效果不明显可应用双氯芬酸钠、布洛芬胶囊等。同时，要注意休息、放松心情、放宽心态。

二、高血压，血压升高也可以出现太阳穴胀痛，用药物控制血压。

三、颅内的病变，可以是脑血管病、颅内的肿瘤，或者是颅内的炎症，需要进一步完善头CT、头部磁共振或者是其他必要的检查，以确诊及进一步的治疗。