儿童指甲凹凸不平的原因有很多。最常见的是各种营养素的缺乏，比如营养性缺铁性贫血，它就会导致儿童手指甲凹凸不平，甚至于出现反甲。

除此之外，还会出现其他的一些临床表现，包括头晕、食欲不振、反应力低下等等。还有凹凸不平可以见于部分的锌缺乏的孩子，他除了指甲凹凸不平之外，还会出现倒刺、指甲上有白斑、食欲低下等等。

同时，还有一些维生素的缺乏，也会引起儿童手指甲凹凸不平。只要针对以上的病因，积极给予补充就可以了。

除此还会有一些孩子由于真菌感染，比如灰指甲这一类的，也会出现手指甲凹凸不平。