肩膀中间疼起水疱可能是由于局部受到外伤引起的张力性水疱。可以在急性期给予局部冷敷缓解症状，或者口服草木犀流浸液片或者是迈之灵，进行水肿症状的改善。

还有可能是由于病毒感染或者长时间摩擦，导致水疱产生。可以嘱咐患者避免肩膀的异常活动，注意休息，给予局部的理疗或者加强换药，防止水疱破裂导致感染的情况出现。

建议及时地去正规医院明确肩膀中间疼痛，引起水疱的根本原因，进而给予合理的治疗。