出现醒来骨头疼的原因有以下几种：

首先，可能是由于受凉引起的。睡觉时长时间吹空调、风扇导致身体受凉，出现醒来骨头疼的现象。

其次，由于剧烈运动或者是参加长时间的重体力劳动引起的过度劳累，也会出现醒来骨头疼的情况。

再有，是睡觉时长时间保持一种姿势，关节受到长时间压迫，醒来也会出现骨头疼的现象。

另外，病毒性感冒的初期也可能出现全身骨头酸痛、乏力等症状。患有风湿免疫性疾病，比如类风湿性关节炎、风湿性关节炎等，同样会出现骨头疼的症状。

出现上述症状后需要引起重视，及早就医。