巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症引起的，是子宫内膜脱落，跑到了卵巢的上面，在卵巢上面，每个月进行增生脱落和出血。

而且会越积越多，会容易导致囊肿越来越大的现象。在这期间还会伴随有疼痛的感觉的发生，会出现进行性的痛经的表现。

在确定巧克力囊肿以后，应该尽快采取手术治疗，这种疾病会有复发的几率。在做完手术以后，还需要通过药物控制病情，避免复发的几率的发生。可以用达菲林治疗。在这短期内复发的几率是比较小的。