先天性肛门闭锁和无肛门没有区别。

先天性肛门闭锁是医学术语，而无肛门是平时老百姓说的话，两者意思完全一样。因为医学知识不丰富，所以也没有几个老百姓能说出来先天性肛门闭锁这样专业的词语，但是没有肛门这种形容是所有老百姓都会的。

先天性肛门闭锁的出现与胚胎时期的基因突变，或者母体受到外界因素刺激有很大关系。在发育时期胎儿的肛门和直肠没有分开，直肠和膀胱又连通在一起，最终导致了先天性的肛门闭锁。它的具体病因尚不十分清楚。