早晨起来头痛的原因可能和以下有关：

1.高血压。清晨是血压的高峰之一，当血压突然之间增高的时候，患者会出现头痛、头晕等不适症状，应根据患者的病情选择药物调整血压。

2.早晨出现头痛可能和血管神经性头痛有关，包括丛集性头痛、紧张性头痛等。发病的时候应给予止痛药物对症治疗。

3.清晨起来头痛，还有可能是由于颅内感染所引起的，包括脑膜炎和脑炎。发病后通过核磁共振检查、脑脊液检查等明确诊断，诊断后针对病因进行系统的治疗。