晚上睡觉时咳嗽比较厉害的原因有：

1.本身存在气道炎症，由于夜间睡觉时气道分泌物不能排出，致使刺激气道，引发咳嗽症状加重。

2.夜间睡眠时交感神经受抑制，迷走神经兴奋，会刺激支气管黏膜收缩引发咳嗽症状加重。

3.咳嗽变异型哮喘，由于夜间温差变化、冷空气刺激可诱发哮喘急性发作。

4.对于存在有上呼吸道炎症或胃食管反流病者，可因卧位时上呼吸道分泌物坠入气道或胃液反流，也可刺激咽部引起刺激性的咳嗽。

需要注意查找引起咳嗽的病因，根据病因对症治疗。